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「青莲聚焦」微量细胞蛋白质组学(从星系到星球)
人阅读 发布时间:2022-02-25 10:07
生命,从单细胞的草履虫到“万物之灵”的人类,都是由细胞组成的。拥有相同基因组的细胞,通过不同的基因表达,造就了不同类型的细胞。同时,每个细胞又在不同的时间、不同的位置,与其它细胞共同协作,从而构成了有机生命体。要了解生命活动的本质,就需要将研究的“分辨率”提高到“单细胞”的水平。现在大部分的组学,测的是某一块组织或者血液中成千上万细胞共同表达的结果,分辨率很低,而所有研究者都喜欢高分辨率的结果。
在单细胞测序技术发展的短短10年时间,已经涌现出众多的技术。总体趋势正在从单个或者少量细胞的研究,向整个组织中所有细胞类型的研究发展。
实验室每天可以产生大量的单细胞的转录组和基因组的数据,但是高通量的单细胞蛋白质组还是不能实现。单细胞蛋白质组学一直是蛋白质组学人的一个梦想。
单细胞的蛋白质定性可以追溯到20年前,Pacific Northwest National Laboratory 用质谱的技术从单个红细胞中鉴定到了血红蛋白,这是单细胞蛋白质组定性的开始,单细胞蛋白质组学的技术手段有很多如:荧光标记,亲和检测、流式细胞、液质联用等;
2018年成立的Erisyon,通过单肽段分子标记荧光并进行埃德曼降解进行序列的定性,通过荧光信号进行定量,此技术需要极少的样本量,但是现在稳定性受限,但是未来可期,可以实现单细胞蛋白质组学定性定量(Marx 2019)。
Erisyon