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「青莲聚焦」阿尔茨海默病中琥珀酰化修饰图谱分析

人阅读 发布时间:2022-03-17 14:57

北京糖基化蛋白质组学


阿兹海默症(Alzheimer’s disease, AD),又称老年痴呆症,是一种常见的神经退化性脑部疾病。大脑葡萄糖代谢异常、称为斑块的蛋白质的异常积累和神经原纤维缠结是阿尔茨海默病(AD)的神经病理学特征。但是它们与疾病的发病机制及彼此之间的关系尚不清楚。本篇文献主要通过琥珀酰化修饰,一种与葡萄糖代谢水平密切相关的蛋白翻译后修饰, 揭示了代谢异常和AD病理之间的潜在联系。
 
北京糖基化蛋白质组学


研究成果于2022年1月20日发表在国际期刊Nature Communications上,题为“Altered succinylation of mitochondrial proteins, APP and tau in Alzheimer’s disease”的研究论文,通讯作者是威尔康奈尔医学院的Gary E. Gibson教授。利用蛋白质琥珀酰化修饰组学和TMT定量蛋白质组学分别对对照组及AD组的脑组织样本进行蛋白定量研究,结果表明琥珀酰化可能将AD相关的代谢缺陷与淀粉样蛋白前体 (amyloid precursor protein, APP) 和tau蛋白的结构、功能、病理改变联系起来。

研究成果

人脑组织琥珀酰化组和定量蛋白质组全局分析

研究人员分别通过非标记定量、TMT标记定量蛋白质组学技术(图1a,c)在AD和健康组脑组织标本中鉴定到314种琥珀酰化修饰的蛋白质以及4678种蛋白质(图1b, d),其中琥珀酰化修饰蛋白组中有20个修饰蛋白质显著差异(其中包括tau和APP)。研究人员将314个琥珀酰化蛋白进行了亚细胞定位分析,有趣的是其中百分之73的蛋白质为线粒体蛋白。其中连接糖酵解和三羧酸循环的丙酮酸脱氢酶复合物E1α亚单位(PDHA1)发生显著琥珀酰化。
 
北京糖基化蛋白质组学
图1:AD及健康脑组织中蛋白质组学谱及琥珀酰化修饰的全局分析

AD脑组织中琥珀酰化蛋白组差异分析

研究人员将对照组和AD组的鉴定到的琥珀酰化蛋白及全局蛋白进行比较。对定量到的琥珀酰化修饰位点进行差异筛选,其中来源于20个不同蛋白的29个琥珀酰化修饰肽段在AD组和对照组之间存在显著差异(图3a,b),其中10个修饰水平显著上调的修饰肽段和19个修饰水平显著下调的肽段,其中绝大多数的修饰水平下调的肽段均位于线粒体蛋白,而修饰水平上升为显著的蛋白则多为胞质蛋白。结果发现两个琥珀酰化水平上升快的且对AD病理至关重要的蛋白质tau K311和APP K612,其琥珀酰化修饰只存在于AD患者的脑组织中,在健康组中并没有出现(图3b,c)。
北京糖基化蛋白质组学
图2:对照组和AD患者的大脑组织中琥珀酰化蛋白差异比较


APP蛋白和tau蛋白琥珀酰化修饰功能分析

研究人员利用模拟AD的模型小鼠 (TgP301S) 通过免疫荧光技术进一步研究APP和tau的琥珀酰化修饰水平与AD疾病进展的关联。结果显示APP赖氨酸琥珀酰化水平的早期上升似乎与Aβ低聚物的聚集相关(图3c)。随后研究人员测试了琥珀酰化与分泌酶处理的APP之间的关系,合成了APP上可被分泌酶识别的序列,发现当序列上带有琥珀酰化修饰时会完全克制其被α-分泌酶的切割,说明琥珀酰化修饰可克制α-分泌酶的切割过程进而促进Aβ生成。此外研究人员还通过体外实验检测到APP K612的琥珀酰化修饰能够加速Aβ寡聚化。
北京糖基化蛋白质组学
图3:AD患者大脑中APP蛋白上K612独特琥珀酰化作用

此外,研究人员发现通过双荧光共定位分析发现,tau的琥珀酰化修饰水平区别于持续增长的磷酸化修饰水平,tau的琥珀酰化修饰水平却随着小鼠年龄的增长而下降而APP的琥珀酰化修饰水平在AD发展中持续上升,这也揭示了在AD发展过程中两种修饰在调节tau功能上存在潜在的相互联系。
北京糖基化蛋白质组学
图4:AD患者大脑中tau蛋白上K311独特琥珀酰化作用

总体来说,本篇文章主要通过质谱技术,利用抗体特异性富集琥珀酰化修饰肽段,发现了与阿尔茨海默症密切相关的琥珀酰化修饰位点,并对AD病理中关键的tau蛋白和APP蛋白上的琥珀酰化修饰功能进行了研究。

阿尔茨海默病中线粒体蛋白、APP和tau蛋白琥珀酰化的变化

期刊名称:Nature Communications

影响因子:12.121

样本选择:AD组和健康组脑组织样本(n=10)

技术策略:琥珀酰化修饰蛋白组学、TMT 定量蛋白组学
 

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