公司新闻

转录组分析已将MAP4K4确定为卵巢癌转移的新型启动子。MAP4K4能够增强细胞粘附，迁移和侵袭，稳定N-钙粘蛋白并促进体内转移。MAP4K4通过在Ser436磷酸化ADAM10来控制N-钙粘蛋白的稳定，导致ADAM10活性降低。综上所述，MAP4K4是一种新颖而重要的抗转移治疗靶点。

本研究的重点之一是设计一个群体学习系统，用于靶标发现和药物疗效研究，以及制备微封装的无机硝酸盐。作者利用微封装技术制备一种安全的硝酸盐纳米颗粒（Nanonitrator），以更好地预防辐射诱导的唾液腺功能障碍。Nanonitrator通过PI3K-Akt信号通路比单独硝酸盐或硝酸盐+ VC具有更大的保护作用。

专注于创新性蛋白质组学检测的北京青莲百奥生物科技有限公司，完成由德联资本独家投资的数千万元Pre-A轮融资。

BPCF2023第四届中国（北京）生物药工艺高峰论坛四月与您相约北京！ 主办单位：生物药资讯 会议主题：BPCF2023第四届中国（北京）生物药工艺高峰论坛 会议时间：2023年04月03-04号 会议地点：北京朗丽兹西山花园酒店

白塞病（BD）是一种多系统慢性血管炎，具有高度异质性，有多器官受累，包括口腔溃疡、生殖器溃疡、葡萄膜炎和皮肤病变，可因动脉瘤破裂或严重的神经并发症而致命。与不同器官相关的BD的分子特征尚不清楚。临床诊断和后续治疗主要取决于临床症状。目前还没有可用于分化不同器官分辨BD的生物标志物。

癌症的生存和发展取决于肿瘤细胞逃避免疫识别的能力，随着对癌症免疫和肿瘤免疫逃逸机制的深入理解，使得免疫治疗法的发展成为可能。一些无法治愈的癌症转移性患者中，免疫治疗产生了前所未有的应答率，具有持久的完全应答的潜力。然而，原发性和获得性耐药机制限制了免疫治疗的效果，进一步的免疫治疗发展需要更深入地了解免疫细胞和肿瘤细胞之间的相互作用。

基于LC的分离方法可以在单细胞蛋白质组水平上实现蛋白质的初步检测。关于分离性能和优化的MS参数、TMT标记载体蛋白能够使单细胞蛋白的检测覆盖率的极大增加；为了解决单细胞检测过程中低通量的问题，可以使用微流体芯片、自动化设备和TMT标记的组合来提高。基于LC的分离方法还存在一些缺点，主要包括预处理时间长、单细胞样品稀释和损失、低丰度蛋白质分离和检测不足等，因此该研究仍有很大的发展空间。

小分子调节剂通过多种机制影响其靶蛋白，对这些生物活性分子的作用机制（MOA） 进行研究可以带来更好的干预治疗。2023年1月3日，哈佛大学医学院Steven P. Gygi团队在Nature Biotechnology（影响因子68.164）上发表了文章A proteome-wide atlas of drug mechanism of action，描述了875种小分子扰动剂的全蛋白质组图谱，并整合数据揭示了蛋白质组中对化学扰动剂最敏感的部分，揭示了配体诱导的蛋白质表达变化和化合物调节其蛋白质靶标的规则。使用蛋白质-蛋白质和化合物-化合物相关网络来揭示了几种化合物的作用机制。

神经元和星形胶质细胞衍生的外泌体已被确定为筛选阿尔茨海默病（AD）生物标志物的最佳来源。然而，很少有研究关注从AD患者血浆中分离的大量外泌体。今天就和大家分享一篇国人佳作，首都医科大学宣武医院贾龙飞团队利用蛋白质组学技术筛查大量血浆外泌体内的蛋白质是否可以作为AD诊断的新型生物标志物。非常荣幸其中非标蛋白质组学以及靶向蛋白验证部分由青莲提供技术支持。

2.8 GHz和9.3 GHz的多频微波处理后7d对胸腺和脾脏均造成明显损伤，处理后28 d恢复。多频微波处理使外周血中的免疫细胞增多，特别是B淋巴细胞，这可能归因于细胞因子升高，以及许多免疫相关基因的上调，如Cxcr5，Blnk和Pik3cd。此外，外周血和脾脏的转录组学和蛋白质组学分析表明，DNA复制，细胞代谢和信号转导的改变可能与微波诱导的免疫激活有关。

该研究用MS表征了FFPE样品中成人型弥漫性高级别（WHO3级和4级）胶质瘤的蛋白质组和磷酸化蛋白质组。确定了IDHmut胶质瘤的两种蛋白质组亚型，包括有氧/厌氧能量代谢。并使用三个独立的胶质瘤蛋白质组数据集进行验证，确认了这些亚组，并将 IDHmut亚型与IDHwt胶质瘤中已建立的原神经和经典/间充质亚型联系起来。总之，该研究强调了代谢分层对神经胶质瘤精准医学的前景，以及蛋白质组学在发现神经胶质瘤这种分层方面的能力。该研究将使得IDHmut胶质瘤患者受益，在未来有助于获得蛋白质组/代谢定向疗法。

本研究基于大队列生物样本的多层次数据（全基因组、表观基因组、转录组和蛋白质组）全面整合分析，将食管鳞癌ESCC分为CCA、NRFA、IS和IM四个分子亚型，在ESCC的每个亚型中，发现了潜在的治疗靶点和诊断标志物，这为未来ESCC的精准治疗提供了坚实的基础。

2022年12月，Matthias Mann团队和慕尼黑亥姆霍兹中心组织工程与再生医学研究所 (iTERM) Ali Ertürk团队合作在CELL发表题为Spatial proteomics in three-dimensional intact specimens 的文章。研究团队将组织/生物体透明化和成像技术、基于深度学习的图像分析、机器人组织提取和超高灵敏度质谱的技术进行结合，开发了一种新的溶剂清除器官的3D成像技术结合质谱分析（DISCO-MS，three-dimensional (3D) imaging of solvent-cleared organs ），实现对全组织区域进行无偏的空间蛋白组学分析，以发现各种疾病模型中初始病理事件相关的空间-分子图谱。

该研究首次发现4EBP1在葡萄糖饥饿条件下可以调节癌细胞的死亡。葡萄糖饥饿诱导非小细胞肺癌(NSCLC)细胞总4EBP1蛋白表达上调，并伴随由高磷酸化状态向低磷酸化状态的转变。PTPMT1(磷酸酶)在此过程中去磷酸化并稳定4EBP1。此外，4EBP1与STAT3(信号转导和转录激活因子-3)相互作用，阻止JAK或ERK磷酸化和激活STAT3，导致抗凋亡基因的表达减少，从而导致细胞凋亡。综上所述，这些发现阐明了4EBP1在葡萄糖饥饿条件下调节细胞活力的关键作用。该研究为肿瘤治疗提供了一种新的治疗策略，即激活PTPMT1去磷酸化4EBP1，从而导致肿瘤核心区域的细胞凋亡。

随着蛋白质组学和质谱技术的快速发展，一些新型酰化修饰在各大研究领域也是相当火热。蛋白质酰化参与了生理和疾病相关的关键过程，如蛋白质稳定性、蛋白质亚细胞定位、代谢酶活性、转录因子的转录活性、蛋白质-蛋白质相互作用和蛋白质-DNA相互作用等。

通过单细胞转录组对肿瘤微环境的深入分析，揭示了KRAS突变型CRC肿瘤的细胞景观，并鉴定了具有KRAS突变的特定细胞亚群。综合多组学分析将KRAS突变肿瘤分为两种不同的分子亚型，称为KRAS-M1（KM1）和KRAS-M2（KM2）。两种亚型在KRAS中的突变残基分布相似，但在预后、遗传改变、微环境失调、生物表型和潜在治疗方法方面具有不同的特征。蛋白质与基因组学分析显示，KM2亚型富集了EMT、TGF-β和血管生成途径，KM2亚型与间充质表型（CMS4亚型）相关，表明基质浸润和预后较差。KM1亚型的特征主要在于细胞周期，E2F和RNA转录的激活，并与染色体不稳定性（CIN）相关的ProS-E蛋白质组学亚型相关，这表明细胞周期蛋白依赖性特征和更好的生存结果。此外，基于三个化合物数据库的药物敏感性分析揭示了KM1和KM2肿瘤的亚组特异性药物。

磷酸化修饰是目前普遍的修饰类型之一，磷酸化的过程就是在激酶的催化作用下，将ATP的磷酸根基团，转移到蛋白的氨基酸侧链上，ATP随之变为ADP。对于大部分蛋白质来说，磷酸化修饰是一种可逆的短暂性修饰。据估计，真核生物中有将近1/3的蛋白，能够在任何时候被磷酸化。磷酸化修饰几乎调节着包括细胞的增殖、发育、分化、细胞骨架调控、细胞凋亡、神经活动、肌肉收缩、新陈代谢及肿瘤发生等生命活动的所有过程。同时，在植物领域磷酸化蛋白的研究，进一步为植物的发育与逆境应答、植物信号与代谢通路的研究等奠定了基础。

结直肠癌（CRC）是全球第四大致命恶性肿瘤，常见的治疗方法是手术、化疗、放疗、靶向治疗和免疫治疗。尽管CRC诊断和治疗取得了进展，但预后仍然很差，副作用和毒性反应的发生严重限制了这些疗法的临床治疗应用。因此，开发创新的抗癌方法对于预防和治疗CRC是必要的。植物来源的小分子化合物，如紫杉醇等已被广泛研究和应用于癌症预防和治疗。β-柠檬酸（EA）因其抗炎和抗癌功能而闻名。据报道，EA 通过消耗谷胱甘肽、下调Bcl-2、上调Bax和抑制 MAPK 信号通路来提高活性氧 （ROS） 水平，从而诱导肺癌 A549 细胞的凋亡。已知EA 可通过衰减 JAK2/STAT3/MCL-1 和 NF-κB 信号通路来抑制前列腺癌细胞的生长，触发去势抵抗性前列腺癌细胞的凋亡。对CRC的左右仍是未知。

许多蛋白质已经被鉴定为具有临床价值的潜在生物标志物，它们几乎是所有细胞功能的直接执行者。大量的翻译后修饰（PTMs）增加了蛋白质的显著多样性，这些修饰可以快速和可逆地响应环境或细胞内刺激，最终将成为生物标记候选物的宝贵资源。所以分析蛋白质及其翻译后修饰对于心脏病、癌症、神经退行性疾病和糖尿病的研究及寻找biomarker尤为重要。

青莲百奥凭借高质量质谱平台，完善的蛋白质组学技术服务解决方案及优质的售前、售中、售后服务，助力客户实现高分文献发表及科研项目的突破。小编整理了部分客户发表的高分文献，与大家共享科研成果！